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空间代谢组学+蛋白质组学探究肺腺癌治疗的新靶点

癌基因KRAS是RAS基因亚家族的一员,RAS基因通常在人类癌症中发生突变,包括肺腺癌。RAS基因编码膜定位的G蛋白,是几个信号级联的组成部分,包括Raf-MEK-ERK信号转导通路。KRAS引起的代谢变化被认为在癌症的增殖和存活中起着至关重要的作用,但KRAS对肺腺癌脂肪生成的调控作用尚不明确。MSI作为一种工具已经被广泛研究,它可以将癌组织与正常组织区分开来,并对各种肿瘤进行分类。在本研究中,作者使用解吸电喷雾电离质谱成像(DESI-MSI)分析kras驱动的肺代谢,并结合基因表达分析、纳米级蛋白质组学和MSI分析来研究肺癌中KRAS突变和脂质特征之间的关系。证实了用治疗剂阻断FASN可以防止kras相关的肺癌细胞增殖。

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医学一区顶刊:靶向代谢组学探究支链氨基酸缓解帕金森小鼠的发病

2022年9月,哈尔滨医科大学附属医院姚丽芬教授课题组(一作:闫珍珍)在Brain Behavior and Immunity期刊发表了题为 “Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果,通过气相色谱-质谱法、免疫学、GC-MS靶向代谢组学、微生物16S rRNA基因测序研究方法,发现了肠道微生物群代谢的动态变化特征,探究了BCAAs调节PD的机理,描绘了BCAAs影响肠道微生物群和炎症因子图谱,为帕金森疾病的深入研究提供了理论依据。

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iTRAQ蛋白质组学——用科学解释“孙行者”的蟠桃内部褐变机制

“玉露”蟠桃为冷敏感型果实,长期的低温冷藏易使果实出现果肉褐变、絮败、糖酸比失调、芳香物质丧失等品质劣变症状,严重影响了果实的食用和商品价值,其中果肉褐变是制约桃果实流通及产业发展的重要瓶颈。气调贮藏(CA)可显著抑制果肉褐变,但作用机理仍需解析。

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蛋白质组学+脂质组学探究多胺对非酒精性脂肪肝的预防机制

亚精胺是一种天然的多胺,对许多物种的健康有好处,可以延长寿命。脱氧丝氨酸合成酶(DHPS)和脱氧丝氨酸羟化酶(DOHH)是利用亚精胺催化翻译因子EIF5A (EIF5AH)翻译后丝氨酸化的关键酶。本研究发现非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者和小鼠以及用脂肪酸处理的肝细胞中,肝脏DOHH mRNA表达降低。

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脂质组+空间代谢组学揭示在乳腺癌异种移植中的毒理学机制

双酚F(BPF)是双酚a(BPA)的主要替代品,已被广泛使用。虽然已知BPA暴露会产生各种毒性效应,但BPF的毒性仍有待深入研究。本文采用一种综合方法,包括基于质谱(MS)的全局脂质组学和代谢组学以及空间代谢组学方法,研究BPF的毒性作用及其对乳腺癌异种移植物对肿瘤转移相关组织(肝和肾)的潜在毒理机制。

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免疫学一区顶刊:质谱流式单细胞蛋白组学揭示免疫衰老保守标志物

2021年01月,美国华盛顿大学医学院研究团队在Immunity期刊(IF:43.474)发表了题为的研究成果,采用单细胞转录组测序 (scRNA-seq) , 单细胞免疫组库测序 (TCR, BCR),质谱流式细胞术 (CyTOF)单细胞蛋白质组学, 表位转录组测序 CITE-seq测序等研究方法,全面描述了免疫衰老的细胞景观,并发现了一个新的衰老细胞标志——表达CD8 的克隆颗粒酶K (GZMK) 并在物种之间保守的T细胞。GZMK CD8 T 细胞的一个独特亚群在在衰老环境中驱动产生,并且可以通过增加 GZMK 的分泌而促成免疫衰老表型。这一系列工作提示GZMK 细胞有望成为解决年龄相关免疫系统功能障碍的潜在靶细胞。

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4D蛋白组单细胞测序+转录组+代谢组+甲基化转录组科研人的七夕CP

复旦大学附属中山医院隋启海、陈振淙、胡正阳为论文的共同作者,詹成教授、林宗武教授为论文的共同通讯作者,在Journal of Translational Medicine,(IF: 5.531)期刊发表了关于顺铂耐药性研究相关成果,揭示体细胞突变、mRNA表达、miRNA表达、代谢物和甲基化与顺铂耐药相关,同时基于BATF3、IRF5、ZBTB38三个基因的表达建立的模型,可以帮助预测铂类药物特别是含顺铂类药物化疗癌症患者的反应和预后,欧易生物提供了该篇文章单细胞转录组测序相关工作。

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微生物组、代谢组和转录组揭示宫颈微生物群与宿主基因调控关系

接受剖宫产手术的女性可能会患上剖宫产瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宫局部切口愈合不良,形成与子宫腔相连的凹陷或空腔,可导致各种近期和远期并发症,之前的研究表明,持续性积液是影响 CSD 女性生育能力的主要因素。

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