微生物组、代谢组和转录组揭示宫颈微生物群与宿主基因调控关系
Time:
Sep 21,2023
研究背景
接受剖宫产手术的女性可能会患上剖宫产瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宫局部切口愈合不良，形成与子宫腔相连的凹陷或空腔，可导致各种近期和远期并发症，之前的研究表明，持续性积液是影响 CSD 女性生育能力的主要因素。
女性生殖道具有独特的微生物组，在维持体内平衡和某些疾病的发展中起着至关重要的作用。当生态失调发生时，改变的免疫和代谢信号会产生相应的反应，包括慢性炎症、上皮屏障破坏、血管生成和代谢失调。之前的研究表明，CSD 持续性积液是由局部炎症和免疫失衡引起的，而局部微生物干扰在这一过程中起着核心作用。然而，局部微生物群活动的特征和微生物与宿主相互作用的机制仍然未知。在本研究中，将非靶向代谢组学和人类宿主转录组相结合，分析了CSD微生物的活性特征以及微生物与宿主相互作用的机制。
研究结果
1、宫颈微生物群的多样性和组成特征
研究共纳入 52 名受试者，其中 CSD 组 28 名，CON 组 24 名。通过Shannon-Wiener指数计算的CSD组门（图1A）和属水平（图1B ）微生物群的α多样性显著高于CON组，表明CSD组的微生物组成显著高于CON组。CSD组更丰富。基于 Bray-Curtis 的 PCoA 图和 ANOSIM 分析显示，CSD 组样本之间的距离明显大于 CON 组（图 1C）。门水平的分类在两组之间显示出不同的模式，在CON组中厚壁菌门占绝大多数（图1D）。在 CSD 组中，厚壁菌门的比例下降到 62%，变形菌门和放线菌门的比例分别增加到 20% 和 10%（图 1E）。两组在属水平上的组成也呈现出显著差异。
本研究剖析了两组之间厚壁菌门和变形菌门的属组成。在厚壁菌门下， CSD组（图1F ）的乳酸菌比例较CON组（图1H）下降，而链球菌和肠球菌的比例增加， CSD 组（图 1G）和 CON 组（图 1I）之间存在不同程度的差异。这些结果表明，CSD组微生物群的多样性和组成与CON组有显著差异， CSD组乳酸杆菌的比例显著降低。
关键词：
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