4D蛋白组单细胞测序+转录组+代谢组+甲基化转录组科研人的七夕CP


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Sep 21,2023

复旦大学附属中山医院隋启海、陈振淙、胡正阳为论文的共同作者,詹成教授、林宗武教授为论文的共同通讯作者,在Journal of Translational Medicine,(IF: 5.531)期刊发表了关于顺铂耐药性研究相关成果,揭示体细胞突变、mRNA表达、miRNA表达、代谢物和甲基化与顺铂耐药相关,同时基于BATF3、IRF5、ZBTB38三个基因的表达建立的模型,可以帮助预测铂类药物特别是含顺铂类药物化疗癌症患者的反应和预后,欧易生物提供了该篇文章单细胞转录组测序相关工作。

2022年6月,来自德国弗莱堡大学医学中心的Dieter Henrik Heiland团队在Cancer Cell期刊(IF:38.585)发表的题为“Spatially resolved multi-omics deciphers bidirectional tumor-host interdependence in glioblastoma”的研究成果,采用空间转录组学、空间代谢组学和蛋白质组学(成像质谱流式,IMS)研究方法,发现了胶质母细胞瘤基本特征,并确立了以免疫和代谢应激因素为标志的微环境,阐述了局部区域肿瘤-宿主的相互依赖性。

这些研究进一步强调了在空间分辨的背景下由于微环境引起的神经胶质瘤的各种转录适应的必要性,为进一步探索早期胶质母细胞瘤复发和治疗抗性提供了重要信息。

2022年3月,牛津大学Julian C. Knight教授课题组在cell发表的题为“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果,通过4D蛋白质组学、转录组技术、流式技术、单细胞测序技术等研究方法,为不同COVID-19严重程度的患者提供了一个综合的多组图谱,并将其与流感和败血症患者与健康志愿者进行了综合比较,将支持未来的COVID-19药物开发、临床试验设计和个性化药物方法。

海军军医大学东方肝胆外科医院及国家肝癌科学中心分子肿瘤研究室主任苏长青教授团队与复旦大学附属华山医院肿瘤转移研究所所长钦伦秀教授团队联合在Journal for ImmunoTherapy of Cancer(IF:13.751)发表具有多重协同抗肿瘤机制的新型溶瘤腺病毒,苏英晗和黎江博士为该文第一作者,苏长青教授和钦伦秀教授为通讯作者。欧易生物提供了该项目单细胞转录组以及空间转录组测序和分析相关工作。

关键词:

蛋白质组学,算法,智能型单细胞蛋白分析系统

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