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单细胞western对抗体有特殊要求吗?和传统western的抗体孵育有何不同?
传统western能够孵育的抗体都可以用于单细胞western。单细胞western的抗体孵育过程和传统western 基本一致,室温下先孵育一抗,然后荧光二抗。区别在于单细胞western不需要转膜,电泳分离结束后,机器会通过紫外光照射将蛋白固定在芯片的凝胶层里,这是该专利技术的核心。新型光敏凝胶材料的蛋白固定率可以达到93.8%,蛋白损失小且背景荧光低,故可以直接在芯片上进行抗体孵育。
设备能够检测的最低蛋白含量是多少?
目前单细胞western最低检测灵敏度是27000个蛋白拷贝数,分子量范围约10-180KDA。
利用单细胞western检测膜蛋白,需要特殊的制样流程吗?
无论是检测膜蛋白还是胞内蛋白,都只需要把样品制作成单细胞悬液即可。
完成抗体孵育的芯片的保存条件是什么?能否反复采集信号?
芯片保存同正常荧光样品一样阴凉避光即可,为了获取更有效的信号数据,建议尽快检测。正常条件下,信号重复采集5次以内,荧光强度没有太大变化。
如果在蛋白上做一些复杂的修饰,是否可以检测出修饰后的蛋白,以及蛋白修饰前后的区别?
检测的关键在于抗体,只要有合适的抗体,即使修饰前后的蛋白分子量差别较小,条带基本重叠也没有关系,通过修饰前后蛋白携带的不同的荧光基团,就可以将表达量区分开。
单细胞western实验需要用到哪些设备和耗材?
实验所需设备有:单细胞免疫印迹仪、共聚焦显微镜/共聚焦芯片扫描仪、光学显微镜、水平摇床、水浴锅、抗体孵育槽(袋)、移液枪,耗材有:芯片及试剂、抗体、离心管、ep管。
信号扫描只能用共聚焦显微镜吗,普通荧光显微镜能够显示吗?
使用普通荧光显微镜或许能够看到高表达的荧光,低丰度的就不可以。由于单细胞内蛋白的量是亚皮克级别,荧光强度很低,故需要用到共聚焦显微镜,或者荧光芯片扫描仪。
单细胞western上样需要多少细胞?单细胞悬液的密度有什么要求?上样方式有哪些?
单细胞悬液的上样量一般在400-600uL,密度在10⁵/ml效果最佳,10000-100000个细胞/ML均可。通常的上样方式是滴定自由落孔,样品很珍贵的情况下,可以采用显微操作的方式,没有落入孔的细胞可以尝试回收。