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脂质组+空间代谢组学揭示在乳腺癌异种移植中的毒理学机制
双酚F(BPF)是双酚a(BPA)的主要替代品,已被广泛使用。虽然已知BPA暴露会产生各种毒性效应,但BPF的毒性仍有待深入研究。本文采用一种综合方法,包括基于质谱(MS)的全局脂质组学和代谢组学以及空间代谢组学方法,研究BPF的毒性作用及其对乳腺癌异种移植物对肿瘤转移相关组织(肝和肾)的潜在毒理机制。
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免疫学一区顶刊:质谱流式单细胞蛋白组学揭示免疫衰老保守标志物
2021年01月,美国华盛顿大学医学院研究团队在Immunity期刊(IF:43.474)发表了题为的研究成果,采用单细胞转录组测序 (scRNA-seq) , 单细胞免疫组库测序 (TCR, BCR),质谱流式细胞术 (CyTOF)单细胞蛋白质组学, 表位转录组测序 CITE-seq测序等研究方法,全面描述了免疫衰老的细胞景观,并发现了一个新的衰老细胞标志——表达CD8 的克隆颗粒酶K (GZMK) 并在物种之间保守的T细胞。GZMK CD8 T 细胞的一个独特亚群在在衰老环境中驱动产生,并且可以通过增加 GZMK 的分泌而促成免疫衰老表型。这一系列工作提示GZMK 细胞有望成为解决年龄相关免疫系统功能障碍的潜在靶细胞。
4D蛋白组单细胞测序+转录组+代谢组+甲基化转录组科研人的七夕CP
复旦大学附属中山医院隋启海、陈振淙、胡正阳为论文的共同作者,詹成教授、林宗武教授为论文的共同通讯作者,在Journal of Translational Medicine,(IF: 5.531)期刊发表了关于顺铂耐药性研究相关成果,揭示体细胞突变、mRNA表达、miRNA表达、代谢物和甲基化与顺铂耐药相关,同时基于BATF3、IRF5、ZBTB38三个基因的表达建立的模型,可以帮助预测铂类药物特别是含顺铂类药物化疗癌症患者的反应和预后,欧易生物提供了该篇文章单细胞转录组测序相关工作。
微生物组、代谢组和转录组揭示宫颈微生物群与宿主基因调控关系
接受剖宫产手术的女性可能会患上剖宫产瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宫局部切口愈合不良,形成与子宫腔相连的凹陷或空腔,可导致各种近期和远期并发症,之前的研究表明,持续性积液是影响 CSD 女性生育能力的主要因素。