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Duncombe TA, Kang CC, Maity S, Ward TM, Pegram MD, Murthy N, Herr AE. Hydrogel Pore-Size Modulation for Enhanced Single-Cell Western Blotting. Adv Mater. 2016 Jan 13;28(2):327-334. doi: 10.1002/adma.201503939.
大多数癌症疗法靶向蛋白质和肿瘤异质性驱动药物反应和耐药性。单细胞分辨率蛋白质组学工具可以提供新的见解。
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Kang CC, Yamauchi KA, Vlassakis J, Sinkala E, Duncombe TA, Herr AE. Single cell-resolution western blotting. Nat Protoc. 2016 Aug;11(8):1508-30. doi: 10.1038/nprot.2016.089. Epub 2016 Jul 28. PMID: 27466711; PMCID: PMC5511750.
描述了如何对单个细胞进行蛋白质免疫印迹以测量蛋白质表达水平和蛋白质状态的细胞间变异。与传 统的蛋白质印迹一样，单细胞蛋白质免疫印迹（scWB）对于缺乏选择性抗体（例如，亚型）的蛋白质靶标 以及来自完整细胞的背景信号混淆的情况特别有用。
Quadri SM. Single-cell western blotting. Methods Mol Biol. 2015;1312:455-64. doi: 10.1007/978-1-4939-2694-7_46. PMID: 26044027.
为了检测这种细胞间变异，进行了一种称为“单细胞蛋白质印迹”的高度先进的技术。
Hughes AJ, Spelke DP, Xu Z, Kang CC, Schaffer DV, Herr AE. Single-cell western blotting. Nat Methods. 2014 Jul;11(7):749-55. doi: 10.1038/nmeth.2992. Epub 2014 Jun 1. PMID: 24880876; PMCID: PMC4077215.
支持 30μm 厚光敏聚丙烯酰胺凝胶的显微镜载玻片可实现蛋白质印迹：将单个细胞沉降到微孔中，原 位裂解，凝胶电泳，光诱导印迹以固定蛋白质和抗体探测。
空间代谢组学+蛋白质组学探究肺腺癌治疗的新靶点
癌基因KRAS是RAS基因亚家族的一员，RAS基因通常在人类癌症中发生突变，包括肺腺癌。RAS基因编码膜定位的G蛋白，是几个信号级联的组成部分，包括Raf-MEK-ERK信号转导通路。KRAS引起的代谢变化被认为在癌症的增殖和存活中起着至关重要的作用，但KRAS对肺腺癌脂肪生成的调控作用尚不明确。MSI作为一种工具已经被广泛研究，它可以将癌组织与正常组织区分开来，并对各种肿瘤进行分类。在本研究中，作者使用解吸电喷雾电离质谱成像(DESI-MSI)分析kras驱动的肺代谢，并结合基因表达分析、纳米级蛋白质组学和MSI分析来研究肺癌中KRAS突变和脂质特征之间的关系。证实了用治疗剂阻断FASN可以防止kras相关的肺癌细胞增殖。
医学一区顶刊：靶向代谢组学探究支链氨基酸缓解帕金森小鼠的发病
2022年9月，哈尔滨医科大学附属医院姚丽芬教授课题组（一作：闫珍珍）在Brain Behavior and Immunity期刊发表了题为 “Role of gut microbiota-derived branched-chain amino acids in the pathogenesis of Parkinson’s disease: An animal study ”的研究成果，通过气相色谱-质谱法、免疫学、GC-MS靶向代谢组学、微生物16S rRNA基因测序研究方法，发现了肠道微生物群代谢的动态变化特征，探究了BCAAs调节PD的机理，描绘了BCAAs影响肠道微生物群和炎症因子图谱，为帕金森疾病的深入研究提供了理论依据。
iTRAQ蛋白质组学——用科学解释“孙行者”的蟠桃内部褐变机制
“玉露”蟠桃为冷敏感型果实，长期的低温冷藏易使果实出现果肉褐变、絮败、糖酸比失调、芳香物质丧失等品质劣变症状，严重影响了果实的食用和商品价值，其中果肉褐变是制约桃果实流通及产业发展的重要瓶颈。气调贮藏(CA)可显著抑制果肉褐变，但作用机理仍需解析。
蛋白质组学+脂质组学探究多胺对非酒精性脂肪肝的预防机制
亚精胺是一种天然的多胺，对许多物种的健康有好处，可以延长寿命。脱氧丝氨酸合成酶(DHPS)和脱氧丝氨酸羟化酶(DOHH)是利用亚精胺催化翻译因子EIF5A (EIF5AH)翻译后丝氨酸化的关键酶。本研究发现非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者和小鼠以及用脂肪酸处理的肝细胞中，肝脏DOHH mRNA表达降低。
